В нуклеокапсиде вируса происходит обратная транскрипция прегеномной РНК. Прегеномная РНК содержит концевой повтор (200 нуклеотидов), образует е-петлю и имеет, как раньше полагали, копию короткой последовательности DR1. Появляется все больше данных о том, что инициация синтеза минус-цепи вирусной ДНК происходит с е-петли, а не с прямого повтора DR1, как полагали раньше. Сначала полимераза соединяется с е-петлей с образованием четырехнуклеотидного оли-гонуклеотида, который гомологичен четырехнуклеотидной последовательности в DR1. Благодаря этой гомологии становится возможным синтез комплементарной последовательности ДНК в направлении копии DR1 на З'-конце. После этого минус-цепь ДНК достраивается до конца РНК-матрицы. Минус-цепь ДНК, в свою очередь, служит матрицей для синтеза плюс-цепи, который начинается…